Европейские структурные и инвестиционные фонды (ESIF, зачастую именуемые «евросубсидии») способствуют развитию экономики стран ЕС, тем самым помогая сгладить различия в развитии между регионами Европы. Бюджетный период Европейских структурных и инвестиционных фондов увязан с бюджетом Европейского союза, т.е. период субсидирования поделен на 7-летние циклы. Структурные субсидии Европейского союза в соответствии с целью и областью субсидирования распределены между тремя фондами, из которых можно ходатайствовать о выделении субсидии:
- Европейский фонд регионального развития (European Regional Development Fund, сокращенно ЕФРР) выделяет странам-членам ЕС субсидии, призванные выровнять развитие различных регионов и укрепить экономическую и общественную связность в Европейском союзе.
- Европейский социальный фонд (European Social Fund, сокращенно ЕСФ) поддерживает начинания, способствующие повышению трудовой занятости, росту квалификации и конкурентоспособности работников.
- Фонд сплочения (Cohesion Fund) субсидирует те страны ЕС, в которых национальный валовой продукт не достигает 90% от средних показателей по Европейскому союзу. Из Фонда сплочения получают субсидии крупные проекты в сфере окружающей среды и инфраструктуры. В числе других стран ЕС субсидии из этого фонда получает и Эстония.
- Европейский сельскохозяйственный фонд развития сельских регионов (EAFRD)
- Европейский морской рыболовный фонд (EMFF)
Эстония начала получать субсидии из Европейских структурных и инвестиционных фондов с 2004 года, в связи со своим вступлением в Европейский союз. До этого Эстония получала от Европейского союза субсидии, предназначенные прежде всего странам, стремящимся достичь статуса члена Европейского союза.